中国科学家完成鲤鱼基因组测序及数据共享平台

来源:    作者:    时间: 2012-04-19

  近日,“十二五”863计划“鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估”(2011AA100402)课题召开工作会,主持人孙效文研究员向来自中国科学院、北京大学、中国海洋大学等单位的相关领域专家进行了“鲤全基因组测序与遗传育种工具开发”的工作汇报。

  该课题完成了鲤鱼200倍覆盖度的全基因组测序,装配获得鲤鱼基因组框架图谱,建立了BAC文库,构建了鲤鱼基因组物理图谱,建立了鲤鱼高密度连锁图谱、鲤鱼-斑马鱼比较基因组图谱、鲤鱼基因组资源数据库和网站。项目组构建的鲤基因组资源数据库网站(Common Carp Genome Database)为公共服务性、界面友好的交互式网站,为非生物信息专业人员查找信息资源和进行在线数据分析提供了平台,将会有力促进鲤基因组资源的广泛共享和利用。

  课题阶段性成果为本项目的顺利完成奠定了良好基础,也为向产业利用方向发展、开展具体育种研究提供了标记工具,对开展难于阐述的复杂的数量性状、杂种优势分析等提供了信息资源。专家建议项目组加快研究步伐,加强国内外合作,将获得的基因组资源用于鲤的分子育种研究。

 
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