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China Feed ›› 2022, Vol. 1 ›› Issue (18): 31-34.DOI: 10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.20221808

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  • Online:2022-09-20 Published:2022-11-18

基于宏基因组测序技术对绵羊呼吸道微生物群落的研究

  

  1. 刘海霞1,韩大勇1,闫 伟1,朱爱文1,周明夏1,王步忠2,吴 昊3,耿昕之1
    (1.江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300|
    2.江苏西来原生态农业有限公司,江苏泰州 225328|
    3.江苏省阜宁县农业农村局,江苏盐城 224400)

摘要: 试验采用宏基因组测序技术对4例呼吸道症状发病绵羊(试验组)和4例健康绵羊(对照组)的鼻拭子样本进行高通量测序,分析不同样品间微生物菌群结构功能差异。结果发现,试验组物种注释上,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门占主导地位|功能注释上,信号传导、氨基酸代谢所含基因数量最多|抗性基因注释上,葡萄球菌和埃希氏杆菌属耐药基因分布最广存在于8个样品中,耐药基因novA、antibiotic、msbA、Mycobacterium、macB广泛存在于除了样品D1以外的其他样品中。发病绵羊呼吸道微生物菌群结构较为复杂,呼吸道菌群结构变化对绵羊机体发病影响显著。
[关键词]绵羊|宏基因组|病原微生物|高通量测序|群落结构

关键词: 绵羊, 宏基因组, 病原微生物, 高通量测序, 群落结构

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