摘要： 本试验通过Pacbio高通量宏基因组测序分析，研究“球虫血痢散”和“肠杆灵散”兽用中草药组方药物应用对鸡肠道菌群结构的影响，并与禽肠道常用抗生素药物硫酸安普霉素进行比较。通过设置3个药物试验组和1个空白对照，连续7 d用药，收集4个试验组鸡大肠段内容物样品，经总DNA提取、PCR扩增及高通量宏基因组序列测定分析。结果显示：“球虫血痢散”和“肠杆灵散”组方药物试验组Shannon指数显著高于硫酸安普霉素组和空白对照组，且组间差异显著（P ﹤ 0.05），其中“球虫血痢散”组方药物试验组ACE值为60.09，表明肠道菌群多样性优势突出|基于Weighted Unifrac距离的PCoA分析结果显示，各药物试验组间菌落构成差异较小，但与空白对照组菌落构成差异较大。在门和种水平上，3个药物试验组中变形杆菌门（Proteobacteria）均呈显著下降趋势，厚壁菌门（Firmicutes）占比上升趋势明显，同时各试验药物对降低鸡埃希氏-大肠杆菌（Escherichia-coil）的比例均优于空白对照组且差异显著（P ﹤ 0.05），表明各试验药物均有利于鸡肠菌群平衡紊乱的改善。其中“肠杆灵散”药物组在提高Streptococcus（非解乳糖链球菌FGM）的丰度占比上要优于“球虫血痢散”组，但硫酸安普霉素组的微生物种类含量比例显著低于2个兽用中草药药物试验组，且均匀性低。因此，2个兽用中草药组方药物在抑制鸡埃希氏-大肠杆菌增殖的同时，更有利于鸡肠道菌群平衡紊乱的改善和维持菌群结构的多样性。
[关键词] 中草药|鸡|肠道|菌群|宏基因组|测序

关键词: 中草药, 鸡, 肠道, 菌群, 宏基因组, 测序