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China Feed ›› 2022, Vol. 1 ›› Issue (3): 39-42.DOI: 10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.20220307

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  • Online:2022-02-05 Published:2022-05-11

多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

  

  1. 冯海霞1,  王金龙1 *,  吕   伟1,  刘胜利2,  马艳艳1
    (1.青岛尚德生物技术有限公司,山东青岛 266111|2.山东隆科特酶制剂有限公司,山东临沂 276400)

摘要: 本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析。试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析。其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spoOA,结合参考凝结芽孢杆菌菌株DSM1的已知管家基因序列,用CE Design V1.04软件设计引物进行PCR扩增,测序结果剪接、串联后,做系统进化树分析。结果显示:16S rRNA基因显示所有菌株的基因序列相似性在99%以上,无法区分菌株间的差异性。而MLST结果显示,国内大部分凝结芽孢杆菌菌株G1-G9、E21和Y1、Y2为第一类别(Bootstrap值≥99),Y3、Y4、Y5三个菌株为第二类别(Bootstrap值≥99),参考菌株DSM1和国内凝结芽孢杆菌菌株差异较大为第三类别。
[关键词] 凝结芽孢杆菌|多位点序列分型(MLST)|管家基因|亲缘关系

关键词: 凝结芽孢杆菌, 多位点序列分型(MLST), 管家基因, 亲缘关系

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