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China Feed ›› 2023, Vol. 1 ›› Issue (17): 7-14.DOI: 10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.2022100030-03

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  • Online:2023-09-05 Published:2023-09-22

基于分离培养和高通量测序分析一种自然发酵饲料的微生物组成

  

  1. 梁国健1,  洪居恳1,  丁茂昌2,  薛   明1,  陈伟哲1,  梁华芳1,  温崇庆1 *
    (1.广东海洋大学水产学院,广东湛江 524088|2.海南海昌对虾繁育有限公司,海南文昌 571300)
  • 基金资助:
    国家重点研发计划“蓝色粮仓”科技创新重点专项(2020YFD0900205)|廉江市养殖集团有限公司委托项目(009)
    作者简介:梁国健,男,硕士研究生,从事水产微生物研究,
    *通讯作者:温崇庆,男,博士,教授,从事海洋和水产微生物研究,

摘要: 为揭示一种对虾养殖用自然发酵饲料的微生物组成,通过MRS、营养肉汤(NB)、豆芽汁(BSJ)平板分别计数其微生物含量,并对分离代表菌株16S rRNA或5.8S-ITS基因进行测序分析和鉴定;分别利用高通量测序16S rDNA V4区和ITS2区研究发酵饲料细菌和真菌菌群的多样性。分离培养结果表明:MRS、NB和BSJ平板对发酵饲料乳酸菌、细菌和酵母菌的计数结果分别为4.80×107、5.00×106、3.95×106cfu/g;从分离代表菌中鉴定出3种芽孢杆菌,4种分别属于慢生乳杆菌属、宿主关联乳杆菌属、干酪乳酪杆菌属和黏液乳杆菌属的乳酸菌,以及1种酵母菌库德毕赤酵母。高通量测序分析表明:乳杆菌科在发酵饲料细菌群落中占绝对优势,并包含20个分类操作单元(OTU)和9个属,其中乳杆菌属和黏液乳杆菌属相对丰度分别为66.95%和3.36%;假单胞菌科、依格纳季氏菌科和微杆菌科分别为第2、第3和第4优势科,其下的假单胞菌属、食肉蝇单胞菌属、假棍状杆菌属相对丰度分别为11.81%、10.16和3.58%;真菌群落中毕赤酵母科占绝对优势,其次为丝孢酵母科,两者分别完全由毕赤酵母属和丝孢酵母属构...更多
关键词: 发酵饲料|分离培养|高通量测序|乳酸菌|酵母菌|芽孢杆菌|

关键词: 发酵饲料, 分离培养, 高通量测序, 乳酸菌, 酵母菌, 芽孢杆菌,

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