一、疾病的卫生防疫原则
防治麝鼠疾病，必须贯彻防重于治的原则，否则，一旦麝鼠患病，养殖户将受到不必要的损失。为了提高麝鼠对疾病的抵抗力，必须加强饲养管理和疾病预防工作，其中搞好环境及饲料卫生，是麝鼠饲养场的首要任务。
（一）饲养卫生：
生产区门口必须设有消毒槽，场内应保持清洁，定期除粪，食盆等要定期或食后洗刷、消毒。可采用下列消毒方法：
二、化学消毒，常用的消毒药有氢氧化钠、石灰乳、漂白粉、来苏儿、新洁尔灭、甲醛、消毒净、百毒杀等。由于不同的病原体对不同的消毒药敏感度不同，因此，要根据具体情况消毒药应用范围去选择，同时、要准确掌握药物的剂量、浓度、作用及温度等，其使用方法通常有喷洒、撒布、浸泡和熏蒸法等。
2. 物理消毒，对垫草、粪尿可采用焚烧和生物发酵消毒。铁丝笼等可用火焰灯消毒。注射器皿、小型用具、工作服等用煮沸消毒法。
3. 定期驱虫，麝鼠患一些寄生虫病，不仅影响其生长发育，而且有些寄生虫病常导致麝鼠死亡。因此，每年都要定期适时驱虫。目前，高效、广谱、低毒的驭虫剂种类较多，可选择使用。
4. 定期灭鼠，鼠是麝鼠某些传染病的直接传播者，也是某些病原的携带者。因此，麝鼠饲养场户应定期灭鼠，切断由鼠传播的疾病。
二、饲料卫生
饲料卫生的好坏与动物的健康密切相关，动物如吃了腐败变质、发霉或被某些病原菌污染的饲料即会发病。某些植物性饲料在加工、贮藏或运输的某些环节不当时，也会导致动物中毒。因此，随时了解麝鼠的饲料是否被污染及麝鼠的饲料、饮水是否符合卫生要求是十分必要的。
1. 化学佳污染，常见的有农药、饲料添加剂、治疗药物等。虽然化学污染毒物含量较低，但有些是剧毒，麝鼠一旦取食，便会发生急性中毒死亡。有些是慢性毒素，麝鼠在长期食用后，会造成慢性蓄积中毒。
2. 生物性污染，生物性污染是指细菌及其毒素，霉菌及其毒素和某些寄生虫的污染。如腐败梭茵、肉毒梭毒素，囊尾蚴，弓形体等的污染。
3. 饲料的卫生要求，饲料室须严密干操、通风好，地面应为水泥面，要防止鼠类进入，不允许在饲料室内存放其它物品。购饲料时要把好质量关，可疑的饲料绝不能购入。现场技术人员对每批新购进的饲料要严格检查其新鲜度，必要时可送往技术监督部门检验。对某些质量可疑的饲料可采用小区饲喂试验，认定没问题时方可大批饲喂。
