一、生药和化药的耐药性问题
我国是世界上滥用抗菌素最为严重的国家之一，无论人用药物还是动物用药都存在滥用问题。由此造成的细菌耐药性问题十分突出。我国临床分离的一些细菌对某些药物的耐药性总数量(例如肠道菌对于喹诺酮类抗生素的耐药性)已飚升至世界首位。
受经济利益驱使，一些沿海和畜牧业发达地区存在超范围超剂量滥用药物添加剂的现象，违禁药物残留造成人体食物中毒事件时有发生，屡禁不止。今年7月中旬，杭州市疾病控制中心又检出乌骨鸡中含“瘦肉精(盐酸克伦特罗)”，造成众多居民受害，其中包括高考学生。这是国内首例禽类肉产品检出违禁药物的报道。滥用药物添加剂高残留导致人体耐药性转移的话题成了行业科技人员关注和研究的焦点，也引起社会的广泛关注和人们的巨大恐慌。有关专家对兽用处方药物滥用问题和饲料药物添加剂使用的总体评价是，滥用情况严重；业内人土意识淡漠，认识不清，人们对此的科普知识了解得太少，对其危害性知之更少；发展趋势不容乐观，若不抓紧治理和积极引导后果不堪设想。
上世纪80年代后期，人工合成的喹诺酮类抗菌素药物，如氟哌酸，氧氟沙星，环丙沙星等发展迅速，广泛用于临床，这类人畜共用的药物品种交叉使用率很高。由于开发新型抗生素的速度远没有耐药细菌产物传播的速度快，即便已有新产品问世，远水解不了近渴。按照审评惯例和法定程序，世界各国政府对新型抗生素的审批期限都在
5-10年间。以我国兽药审评程序为例，申请方需提供药理学实验—毒理学实验—特殊毒理学实验—繁育实验—残留实验—环境毒性—临床实验或临床验证—疗效实验—产品质量标准等等一系列实验数据。有的一类药审评走过了20年，迄今尚无结论。照此下去，有专家悲观的估计，中国人将可能自食其果，率先进入“无抗生素时代”，即回到抗生素发现之前的黑暗时代，现有的抗菌素都无法消灭或杀死由细菌耐药性和耐药性转移而造成的细菌，那绝对是人类的特大灾难。其后果决不亚于空难，交通事故，海啸，地震，可能造成人类毁灭的说法并非危言耸听。
所谓耐药性是指某个菌种作为一个整体对某种抗生素不再敏感，抗生素对它们不再起作用。细菌耐药性一旦形成，不论感染在哪个人的身上，抗生素都不能有效的杀灭或抑制它们。因此，耐药细菌的危害会对整个人群健康构成威胁，而不是有人理解的那样：“谁滥用，谁受害”。这个科学道理决非空穴来风夸大其词，潜在的危害已经摆在了我们的面前。照此下去，人类将可能自食其果。
不仅如此，更为严重的是耐药细菌可以从一个区域转移到另一个地区或多个地区，从一个国家转移到一个或多个国家。甚至从人传给动物，动物传给人。随着人们交流的频繁与便捷，世界经济全球化的进程，人流，物流，信息流更加畅通，耐药菌种的传播速度越来越快，范围越来越广。所以，细菌耐药性和耐药性转移已成为全球性的、世纪性的严肃命题。已引起各国政府和科学家的高度重视。
在发达国家如美国，买药比买枪难得多。这些国家对药品的销售管理非常严格，药店只能出售非处方药
(OTC)，病人不可能随意买到抗生素之类的处方药。动物患病，除非有兽医出具的兽药处方，否则也不可能在兽药店买到兽药。而我国的情况恰恰相反，走进大大小小的药店或兽药门市部和饲料交易市场，各种抗生素琳琅满目，应有尽有，给钱就卖。
在饲料中添加入低于治疗剂量的抗生素不可避免的降低了肠道微生物的发酵水平，从而提高了饲料转化率，其治标效果极为明显。但是早在1968年，Smith发现了由于饲料中滥用四环素，抗四环素抗性因子开始出现在肠道病原菌中。虽然1971年英国全面禁止四环素类抗生素在饲料添加剂中的使用，Smith在1975年的追踪调查中却发现抗四环素抗性因子在猪肠道大肠杆菌中的含量并没有明显下降。Langlois在1983年的进一步实验中也发现了即使猪停止使用四环素类抗生素达10年之久，抗性因子的含量只下降了50％。由此可见，抗生素对畜禽肠道微生物的污染和人类对自然环境的破坏同样可怕，需要相当长的修复时间。更可怕的是自然界的破坏极易引起人们的关注，而滥用抗生素对畜禽肠道微生态系统的破坏却长期被人们所忽视。
二、微生态制剂同样存在耐药性问题
上世纪50—60年代正是抗生素研究、生产和使用的鼎盛时期，微生态制剂生不逢时，在强大的抗生素面前节节败退溃不成军，研究和开发工作也处于低潮期，相当长的一个时期以来没有受到人们足够的重视。直到80年代中期情况才有了根本性的扭转。人们发现滥用抗生素不仅使动物抗病力减弱，药物残留问题严重，肉蛋产品质量下降，而且可能派生出任何抗生素都无法消灭的”超级细菌”。针对抗生素，激素和兴奋剂类残留问题导致的严重后果和恶性循环对人类健康直接造成毁灭性的威胁时刻，人们开始觉醒了，科学家们重新审视动物药物添加剂的研究方向，把目光投向具有生长促进作用和保健效果的饲用微生态制剂，试图改变人们对抗生素过分依赖的不良状况。
从80年代起世界各国，尤其欧洲，日本等发达国家首先采取法律法规等官方强硬的措施，对饲用抗生素的种类，使用方法，剂量和配伍等方面严加限制。人体细菌产生耐药性和耐药性转移的事实再度引起了社会的极大关注。1998年，欧盟起先允许使用7种抗生素，随后当年就取消了其中5种，仅存的斑伯霉素和盐霉素2种抗生素的前景也是岌岌可危。欧盟成员国瑞典已经宣布禁止使用所有的抗生素。随着动物食品消费市场的进步，欧盟全面禁止使用抗生素只剩下时间表的问题了，使微生态制剂再一次地受到世人的瞩目。科学家们努力研究和开发药物饲料添加剂代用品，政府积极鼓励和倡导绿色安全饲料添加剂的研究和推广。1996年中国农业部批准枯草芽孢杆菌，乳酸杆菌等6个菌种生产生物兽药。1999年农业部公布了干酪乳杆菌，植物乳杆菌和粪链球菌等12个菌种可直接饲喂动物，为我国微生态制剂在饲料和动物生产上的应用提供了法规方面的支持。
我们必须清楚的认识到并不是所有的益生菌都是绝对安全的。有的益生菌含有的抗药因子可以通过基因物质的交换转移到正常的肠道菌群中。现在有人把含有抗药因子的基因工程菌用做益生菌，其结果将会和滥用抗生素一样，制造出任何抗生素都无法消灭的”超级细菌”，将给人类造成更大的威胁。这就是人们常说的”矫枉过正，物极必反”的道理。不能一概而论凡天然物质或天然物质提取物一定是安全的，超剂量的添加和滥用天然物质或提取物对动物仍然是有害的。科学家在研究益生菌的同时，必须下大力研究动物肠道菌菌群自身的特点及与寄主和环境之间的关系。
