（一）畜牧机械企业高低端产品区分不明确畜牧机械企业林立，产品众多，但在存在着建筑随意，缺乏合理性；人畜混居，环境质量差，存在共患病隐患的农村饲养模式下，这些机械并没有推广。其实这并不是农民对科技含量高，构造合理，方便易用的畜禽设施没有好感，而是对其价格望而却步。价格的持高不下的原因是企业的研发能力差，一味的靠经验制造，这样必然导致无谓的材料浪费，从而价格降低空间小。如果能够投入一定的研发资金，与农村因地制宜，在能够满足动物生长所需的环境条件下，将原有机械设备进行改造，生产出复合农村实际资金承受力的低端产品，那么，企业将会极大的拓宽业务领域。通理，对于高端市场，研发能力更是必须的。例如，日本许多企业在第一代产品的同时，其衍生产品就已经在研究了。
（二）畜牧设备节能性差，缺乏精细理念中国虽然资源丰富，但是由于人口众多，人均资源往往只是世界平均的几十分之一甚至几百分之一。如何有效的利用能源，维持各产业的可持续发展是近几年的热门话题。在畜牧工程产业当中，同样应该认识到这个问题。但是，许多畜牧设备企业缺乏精细的经营理念，对不同类型的设备制造过程中，往往不经过计算，一概用高质量材料，造成了资源的严重浪费。 王 教授举例说，对于冬季猪舍的加温，部分农户的做法是全舍加热，但是猪的活动区仅位于地面至地面以上 1 米 处，全局加热无疑是对资源的巨大浪费；而局部加热不但节省能源，且环境容易控制。又如目前热风炉的推广颇具争议， 王 教授认为，热风炉确实存在一些问题，如运营成本高，热效率低等，有些企业称可以通过回流方式使热效率达到 90 ％，但这个数字还是个问号，应当通过实验手段对其燃烧效率值进行精细分析才能得到结论。针对以上问题， 王 教授提出，企业往往认识不到降耗与研发的承托关系，投入用于研发的资金是可以转化成降耗的，由此成本可以降低，还可对资源的有效利用，提高企业的科技含量成分，何乐而不为？
（三）产品整合性差，缺乏局部调控综合运用目前的畜禽舍设备往往是独立工作，缺乏整合性，造成了投资高，资源利用不合理。例如，在畜禽舍环境中，畜体所感受的温度是温度与湿度共同作用的有效温度，而不是实测温度。高湿环境对于畜体会产生负面影响，有些喷淋降温设备往往只注重设备降低了多少温度，没有同时考虑增加的湿度，这样可能会存在温湿度间的矛盾，使购买者白白投资。整合型产品往往可以降低成本，综合利用能源。
最后，王新谋教授认为，应该有一批人提出畜牧工程目前存在的问题，专家共同讨论，这样虽然不一定会有结论，但是大家共同的声音终究会引起社会各方面的重视，从而快解决方案的推出。
