全国第一次污染源普查数据显示，2007年，我国规模化畜禽养殖场（小区、专业户）的畜禽粪便产生量为2.43亿吨，尿液产生量为1.63亿吨，已居农业污染源之首，且已成为部分水体水质恶化的重要污染源，严重影响村镇人居环境和人体健康。
据世界卫生组织和联合国粮农组织资料，动物传染给人的人畜共患传染病达90多种。
环境保护部污染物排放总量控制司的黄小赠处长介绍说，畜禽养殖污染防治工作现阶段还存在着很多问题，例如相关法规和标准体系建设滞后，管理机制不健全；资金投入严重不足，无法实施有效治理和监管；技术推广和服务体系建设滞后，基层管理人员缺乏等。
目前，开展对农村集镇生活污水处理和规模化畜禽养殖污染减排已纳入“十二五”重点规划，各级地方政府相继出台了地方性法规和制度，积极开展畜禽养殖污染专项治理行动。
