然而，防控重大动物疫病，重点在县乡，难点在村庄。目前，我国64万余个行政村共设有村级防疫员64.5万人，尽管数量庞大，但是队伍并不稳定。学员们一致呼吁：应该进一步完善兽医工作机制，加快推进基层兽医队伍建设，建立基层兽医的保障制度，改善他们的工作条件、提高他们的工资待遇。
首先，提高基层防疫员工资待遇。村级防疫员工作量大，但是待遇低，记者对畜牧业大县局长采访时了解到，待遇较高的有北京地区，每月近1000元，待遇较低的如河北省徐水县，每月只有80元。贵州省盘县农业局副局长唐世政说：“我们县的村动物防疫员每个月的工资只有200元，一年的收入也才2400元，工资远远低于出外务工收入，根本无法调动防疫人员的工作积极性，留不住人，稳不住队伍。”学员们普遍建议把基层动物防疫员工资纳入中央、省、市、县四级财政预算之列，稳定在每月1000元。
其次，建立基层兽医的保障管理制度，出台相关政策保障基层兽医权益。“村防疫是整个防疫体系建设的一个重要环节，基层兽医在乡村工作时存在风险，经常遇到一些意外伤害。有时在注射狂犬病疫苗时被狗咬了，有时在注射疯牛病疫苗时被牛踢了，他们经常跟畜禽接触，得病几率相对高，希望能够出台一些政策，如将村级防疫员纳入社会保险体系内，免除他们工作的后顾之忧。”云南红河建水县畜牧兽医局局长李树明的建议也代表了大多数学员呼声。
再次，改善基层兽医的工作环境，提高动物防疫的装备水平。甘肃省清水县畜牧兽医局陈景华说，该县乡村动物防疫人员的装备水平很简陋，大多数疫苗需要低温保存，防疫期间村防疫员从本乡镇动物疫病预防与畜牧技术服务中心的低温保藏柜领取疫苗后，分赴各村、组免疫注射，一天或几天更换一次，疫苗质量会受到严重影响，应该给每个乡镇的动物疫病预防中心配备一辆疫苗配送冷藏车。此外，交通工具，检疫、检测设备等也亟待完善。
最后，吸纳年轻的专业技术人才，加大对基层兽医的专业技术培训力度。目前，一些乡镇的兽医人员大多在40岁以上，年轻人数量少，而且专业技术人员匮乏，文化程度不高。人员不专业，给当地防疫工作带来很大困难，建议通过相关人才政策吸纳专业技术人才。同时，鼓励基层兽医参加畜牧兽医职业技术学校、农业广播学校的资格学历学习，逐步提高素质，建立一支人员素质高、业务能力强、运转畅通、保障有力、适应当前新时期畜牧业发展需要的动物防疫队伍。
