该《办法》的起草声明中指出，调查显示70%的动物疫病发生都与动物的移动相关。其中，散养动物作为疫病防控和产品安全方面的薄弱点和风险点，受到了重点监督和控制。禁止散养动物跨省调运规定的出台就是基于该背景。
此外，目前我国大力推进规模化养殖的时机已经成熟，规范跨省调运动物的管理，可以加快目前动物养殖方式的转变进程。业内人士表示，农业部禁止散养动物跨省调运的考虑，除了因为散养动物存在较大安全隐患，还希望通过缩小其销售渠道，来控制发展规模，鼓励更多的养殖户从散户养殖转化为规模化养殖。
农业部特别指出，《办法》实施不会造成肉品短缺和肉品价格上涨。“办法的主要目的是控制动物跨省调运，禁止散养动物跨省调运，通过控制动物跨省调运来控制动物疫病的传播，但不限制动物产品跨省调运。”目前我国生猪、蛋鸡、奶牛规模化养殖比例分别为61%、79%、42%，具备条件的规模养殖场饲养的动物均可跨省输出，畜牧养殖大省主要商品畜禽的流通不会受到影响，《办法》可以促进各地实施规模化养殖和动物屠宰加工行业的发展，不会影响肉品供应和价格上涨。
