此次2010年畜牧良种补贴项目执行情况与资金使用情况专项检查，以指导项目实施、促进项目进度、保障项目实施成效为目标，以提高资金使用效率、规范资金管理、保障资金安全为核心，确保项目资金安全高效使用，坚决纠正套取挪用项目资金、弄虚作假、坑农害农、以权谋私等违规行为，切实维护畜禽养殖场户利益。
畜牧良种补贴项目执行情况方面重点检查2010年畜牧良种补贴政策落实情况，生猪、奶牛肉牛、绵羊良种补贴等项目进展及管理情况。畜牧良种补贴资金使用情况检查包括精液、种公畜采购合同签署与履行是否规范，供精公牛是否为当年公布的种公牛，精液采购数量是否符合相关规定，精液及种公畜价格是否合理等；检查项目实施单位补贴精液及种公畜采购和使用账目是否完整，生猪良种补贴项目财政报账制实施情况，结算资金是否及时，手续是否完整等方面。
此次专项检查采取首先开展全面自查的方式，要求各省级畜牧部门组织开展本地区2010年畜牧良种补贴项目工作自查工作，形成自查报告，并填写汇总表，于10月15日前将自查报告、省汇总表和种公牛站、种羊场调查表报农业部畜牧业司。在各单位自查的基础上，农业部于9月至10月，组织6个督导组对部分省份开展重点检查，每个省至少抽检两个项目县，进行现场检查，查验原始记录。最后，听取地方畜牧部门汇报，并召开由种公畜站、种羊场管理和技术人员、人工授精技术员、养殖户、项目管理人员参加的座谈会。
