业主和饲养管理人员素质较低
小型饲养场的从业人员主要是农民，也有外来务工或回乡的农民，也有一小部分下岗失业人员。他们的文化水平普遍较低，文化层次参差不齐（有高中、初中、小学毕业的）绝大多数没有系统的学习过科学养殖知识，仅仅是看一看养殖方面的专业书，听几次专家几小时的专题讲座，就从事养殖工作。还有一部分人当看到养殖效益好时，就盲目上马，而自己一点也不懂养殖知识，在饲养过程中，全听有经验的养殖户指点就从事饲养工作。
养殖场地大都不符合防疫要求
有相当数量的养殖场地是利用住房或因资金场地限制建起的简陋的饲养场，饲养场的周围是居民区。
动物防疫情况存在的问题
绝大多数的饲养者都认识到传染病是养殖畜禽的大敌，不搞好防疫就会给自己带来严重的经济损失，因此畜主都十分重视动物疫病的防治工作，整个养殖过程中，都能积极主动地购买疫苗及消毒药进行防疫和消毒工作。初具规模的养殖户一般也只听有养殖经验的养殖户的安排，人家怎么做，他就怎么做，存在很多问题：养殖户对免疫接种十分重视，但对免疫监测不重视，认识不到位。
对免疫后的畜禽基本不进行免疫监测。其实免疫监测是检验免疫质量的最直观最有效的方法。只有监测合格后，免疫接种才能成功。常见到有的养殖户疫苗没少用，消毒经常搞，但动物的疫病特别是口蹄疫、高致病性禽流感、猪蓝耳病等动物重大疫病仍时有发生，原因就在于没有进行免疫监测。
动物免疫程序较乱
小型养殖场户的免疫程序大都是从兽药经营户那里听来的，没有统一、科学的免疫程序。
疫苗的来源较杂
有从兽药饲料门市购买的，也有买小鸡、小猪时从供种厂家带来的。这样的疫苗供应存在着较多问题。疫苗是否来自国家定点生产厂家，疫苗的运输、保存是否按要求冷藏保存与运输都不清楚。
抗生素和违禁药物问题
部分养殖场当畜禽发病时滥用抗生素及违禁药物，使动物产品的药残超标，严重危害消费者的健康。还有部分养殖户为了提高自己的养殖效益，使畜禽产品卖个好价钱，将消费者的身体健康、国家法律抛在脑后，在饲养过程中使用国家法律明令禁止的药品，如“苏丹红、瘦肉精”等，严重危害消费者的身心健康。这样的养殖户一般也发不了财，一旦被查处，所有的畜禽及产品会被依法销毁，同时被罚款。
建议
所有从事畜禽养殖的专业户必须参加相应的养殖培训班，通过学习和培训，从理论和实践上掌握科学养殖技术，只有这样才能生产出绿色无公害产品。
在掌握科学养殖技术的同时也要了解《动物防疫法》及配套的法律、法规，这样在饲养生产中做到知法、守法、合法经营，不使用国家明令禁止的药品，才能生产出无药残、绿色无公害产品。
按照防疫的要求，对饲养场进行科学合理布局，生活区、生产区严格分开，严禁闲杂人员，特别是养殖同行随意进入生产区，进出口设消毒池，对进出的车辆及人员进行严格的消毒，以防止疫病传入和传出。
对从外地购进的畜禽必须进行严格的检疫，并隔离饲养半个月以上，经确诊无病后，方可合群饲养。
按照科学的方法进行免疫。一是购买疫苗要从有疫苗经营许可证的门市购买。二是对国家规定的重大动物疫病，防疫所用疫苗必须注射到位，并建好免疫档案，为了保证免疫效果，在规定的时间内做了抗体监测。
主动接受当地畜牧兽医部门的管理，购进或出售畜禽时主动报检，对在养殖过程中不明原因死亡的畜禽进行焚烧、深埋等无害化处理。严禁乱扔和出售，防止病源扩散和传播。
搞好环境卫生和常规消毒，特别是对清理出的畜禽粪便要集中存放且外面用泥盖严，以使粪便发酵，防止疫病扩散与传播。
