畜禽养殖业造成的环境污染或许被低估。环保部和农业部最新公布的数字显示，2010年，全国畜禽养殖业的化学需氧量和氨氮排放量分别达到1184万吨和65万吨，占全国排放总量的比例分别为45%、25%，占农业源的95%、79%。
环保部与农业部近日印发的《全国畜禽养殖污染防治“十二五”规划》（以下简称《规划》），该规划全文目前尚未发布。环保部官方媒体《中国环境报》在介绍《规划》时，引述了上述数字。
在中国，工业污染在多年间一直被认为是环境污染的主要原因，直到最近两三年，环保部门的污染源普查才证实接近一半的污染其实由农业面源导致。畜禽养殖业，一直被环境学界认为是农业面源污染的最大来源，但其“贡献”到底如何，一直缺少官方统计数据。
中国环境报的报道显示，《规划》指出，中国畜禽养殖污染防治工作相对滞后，畜禽养殖污染日趋严重。畜禽养殖污染已经成为中国环境污染的重要因素源。
《规划》要求，到2015年，基本摸清全国畜禽养殖污染状况，基本健全畜禽养殖污染防治法规标准体系，提升畜禽养殖环境监管和污染防治科技支撑能力，加强畜禽养殖废弃物综合利用和污染治理设施建设，并基本解决严重危害群众健康的突出畜禽养殖污染问题。
根据《规划》，规模化养殖场(小区)和污染严重的养殖密集区域将被列入重点防治单元，养殖总量大、污染负荷重、国家水污染防控重点流域和区域等将被列入重点防治区域。
据上述报道，《规划》提出，至2015年，全国畜禽养殖化学需氧量、氨氮排放量应较2010年分别减少8%、10%以上，分别新增削减能力140万吨/年、10万吨/年。
2012年7月，国务院法制办曾公布《畜禽养殖业防治条例（征求意见稿）》，并向公众征集意见。征求意见稿指出，养殖业属于弱势产业，污染防治不宜给养殖者造成不必要的负担，不宜采用工业污染治理的制度和措施。目前，《畜禽养殖业防治条例》尚未得到正式批复。
