如何解决养殖产品药物残留的问题，一些专家近年来提出了用中草药、益生菌等代替物取代抗生素的思路。许多企业与科研人员在这方面做了大量的研究与应用试验，验证了中草药作为饲料添加剂的各种功效。
山东农业大学动物科技学院教授唐辉介绍，“与西兽药饲料添加剂相比，中草药饲料添加剂有其优势:
一是它具有多种营养成分和生物活性，兼有营养物质和药物的两重性，既可防病治病，又可提高动物的生产性能；
二是不易在动物体内形成残留，从而保证动物产品的品质；
三是动物一般不会对中草药产生耐药性，不会出现因耐药性问题导致的‘药效越来越低——用药量越来越大——残留越来越严重’的恶性循环现象。”
经过研究，专家发现可以用金银花、连翘、大青叶、牛蒡子、马齿苋、鱼腥草等中草药代替抗生素。
专家认为，饲料中添加中草药可明显改变肠道细菌组成及数量，使有益菌类增加，并抑制大部分条件致病菌的生长。而且中草药添加剂在畜禽体内发挥有效作用后可被分解，没有毒害与残留。效果虽然好，但实际应用推广中却并不理想，养殖户并不买中草药的账，“这就像人感冒了习惯于打吊瓶一样，鸡生病了也是先用西药，见效快，感觉保险。”专家们对此也很无柰。
“养殖场试着在饲料或饮水中添加中草药，但只能起保健作用，没办法完全代替抗生素。”一肉鸡养殖户坦言，“中草药确实能治好部分禽病，但目前中草药研制公司良莠不齐，市面上中草药饲料添加剂产品鱼龙混杂。同一个药名，里面可能有十几种中药，不同的药厂给出的药剂配比、含量都不太一样，有的有效，有的无效。”他说，作为养殖户，看重的是效益，不敢冒险乱试，“什么药药效好，价格便宜，就用啥药。”
山东华牧天元农牧股份有限公司董事长刘玉民表示，当前中草药代替抗生素还有很远的路要走。“成本和效益是养殖场考虑是否采用其他替代物的主要因素，目前中草药防治动物疫病还处于科研公关阶段，无论是成本还是疗效都比不上抗生素好，农户接受度不高，真正推广还需要时日。”
唐辉认为，中草药药效不稳定，使用不方便，也是造成难以普及的原因。他解释，由于饲养条件和组方的差异，不同的品种、不同的生长阶段、不同的季节、不同的水土、不同的饲养方式、不同的营养水平，使用同一种中草药饲料添加剂都会产生不同的使用效果。
专家认为，现行许多中草药饲料添加剂产品粗糙，多为经过简单加工的中草药混合物，中草药配方也没有固定标准，质量检测无据可依，中草药配方存在一定的动态性。用量大、起效慢，质量低下，很难适应营养水平饲养和畜牧业规模化、集约化发展的需要。刘玉民表示，禁止在饲料中添加抗生素是一个必然趋势。抗生素正逐步退出历史舞台，取而代之的将是一些绿色高效的新型饲料添加剂，如中草药饲料添加剂、微生态制剂、酶制剂、酸化剂。在替代抗生素的努力中，不可以指望依靠某种单一的生物制剂产品就能够毕其功于一役，而是需要多种产品或措施的交替和配合使用，“同时还需要饲养措施、饲养环境、产业政策及专业法规的积极配合，才能真正使生物饲料添加剂发挥作用，解决饲料中存在的滥用抗生素问题。”刘玉民介绍，为了促进中草药的使用，公司正在利用微生物研发的优势处理中草药，以增强药效，减少中草药用量，降低成本，方便使用，“两者结合，才能让微生物和中草药在养殖中发挥出更大的作用。”有了微生物这个帮手，刘玉民对开发中草药很有信心。
