1．抑制有害菌的繁殖，使肠内菌群保持正常
抑制和阻止肠内有害菌的发生，使有益菌增加，恢复维持健康的肠内菌群。主要的抑制病原大肠菌、梭状芽胞杆菌、沙门氏菌、β溶血性类细菌等的繁殖。
2．产生消化酶，合成维生素可以产生淀粉酶和蛋白酶等消化酶以及维生素B群，另外维生素A的合成也已被证实。
3．增强免疫作用
通过刺激肠道内免疫系细胞，增加局部抗体的形成，从而增力。巨噬细胞活性。微生物饲料添加剂可使肝脏内大量蓄集有增强免疫作用的维生素A。
4．产生过氧化氢
过氧化氢对几种潜在的病原微生物均有损害作用，它是由一些特殊的物质在一些基质上形成的。
5．优化生态环境
益生素、酶制剂在动物肠道代谢过程中，分解了不易被动物吸收利用的粗蛋白质、植酸酶及抗营养因子，明显防治了蝇蛆的滋生，有效切断了氨气、臭气的来源，使动物粪便中有害气体的浓度得到了有效降低，改善了饲养环境，降低了氨气对人体的侵害，预防了畜禽呼吸道及肠道疾病的发生。
