2014年12月10日，广济药业在欧洲发布声明称，其关注到欧盟委员会在2014年12月4日发布的通告，关于产自中国的饲料级维生素B2中检测到转基因枯草芽孢杆菌残留事件。到目前为止，广济药业没有接到任何终端客户，经销商或者是相关机构的信息能够表明此事与广济药业有关。
2014年9月5日欧盟委员会通告，来自中国的饲料级维生素B2检测到转基因菌种片段，该片段是枯草芽孢杆菌，欧盟要求不得在B2产品中检测到菌种或基因片段残留。随后，广济药业在2014年10月22日，在欧洲相关媒体发布声明称公司生产工艺流程可保障在终产品中无转基因DNA片段残留，并委托国内研究机构，通过电泳和全波段扫描两种方法没有在终产品中检测到DNA残留。同时随机采样8个批次的维生素B2，采用液体培养的方法，在培养基中没有培养出维生素B2菌种。
据欧盟委员会12月4日通告，在产自中国的饲料级维生素B2中检测到转基因枯草芽孢杆菌残留，该批货物经瑞士中转，被分销到丹麦、墨西哥、英国等地。这次是由英国食品标准委员会报告给欧盟委员会。
广济药业针对此事，再次声明其维生素B2产品中不含有转基因片段、突变、DNA或重组DNA残留，是符合欧盟相关法规的。
